政府转型不仅是发展方式转型的前提，也是有效推进改革的前提，只有推进政府转型，政府才能站在历史高度驾驭第二次转型，争取第二次转型的主动。
1. 政府仍作为经济建设主体，很难统筹和谋划中长期的科学发展
中国于2003年就提出科学发展观，能源消耗、环境保护、就业、产业结构、收入分配差距等指标也逐步被纳入到相关中长期规划中。政府作为经济建设主体与政府在科学发展中扮演的角色有着难以克服的体制性矛盾。从近年来的宏观调控实践看，政府作为经济建设主体，往往把注意力集中在短期的经济总量波动上，很难顾及中长期可持续发展的要求。
（1）宏观政策的关注点侧重于总量而非结构。但这些年政府宏观调控的主要着眼点是防止短期的“过热”和“过冷”。而能源消耗、环境保护、就业、产业结构、收入分配差距等中长期目标在宏观调控中很难得到兼顾。
（2）宏观政策的关注点侧重于短期而非中长期。例如，在实施积极的财政政策、适度宽松货币政策的时候，往往会助长垄断行业的扩张，造成“国进民退”，不利于就业和产业结构等调整目标的实现。在实施紧缩性财政、货币政策的时候，真正紧缩的也常常是民营经济和中小企业，同样不利于中长期目标的实现。
（3）宏观政策的关注点侧重于“治标”而非“治本”。深化改革是转变经济增长方式的根本途径。这在20世纪90年代已成为社会的共识，“十一五”规划也提出把改革作为经济增长方式转变的根本途径。，为破解经济增长方式转变难题提出了非常好的思路。但是由于政府作为经济建设主体的角色没有改观，经济增长方式转变的目标不仅没有真正实现，在某些方面还有所恶化。从中改院2009年改革调查问卷看，合计有67.79%的专家认为，“十一五”行政体制改革没有达到预期效果，制约了转变经济增长方式相关改革的实际进程。
